A ação do homem também tem grande relevância na determinação da velocidade dos ciclos biogeoquímicos. Em alguns casos, essa ação pode modificar de forma irremediável os ciclos. O homem pode alterar os ciclos biogeoquímicos através de atividades como mineração, agropecuária, produção de energia e despejo de esgoto em corpos d’água.
A ação do homem pode consumir ou disponibilizar quantidades desses elementos acima do que a natureza pode absorver ou liberar. Isso leva ao estresse e sobrecarga dos ciclos, causando danos graves aos ecossistemas.